Pod Lukešovým vedením Národní muzeum opravilo většinu svých objektů – Národní památník na Vítkově, České muzeum hudby, Národopisné muzeum. A především, historickou budovu Národního muzea, jehož rekonstrukci plánoval od roku 2006 a kterou propojil s budovou někdejšího Federálního shromáždění, kterou pro muzeum získal. Nyní se z manažera, který průběhem let poznal rozličné stavební profese a postupy, stane na plný úvazek ředitel muzea. Těžiště jeho aktivit se z diskusí s památkáři posouvá na plno k vědě a její popularizaci. „Muzeum bude plné moderních expozic s prostory připravenými na velké projekty. A plánuji spustit digitální revoluci. Nechceme muzeum posouvat někomu do obýváku. Ale chceme se mu do vnutit do obýváku a lákat ho, aby do muzea přišel,“ říká Lukeš v podcastu Welcome the Future.